Наруто Удзумаки  — главный герой. Гиперактивный, энергичный, целеустремлённый и прямолинейный. Является носителем девятихвостого лиса; все взрослые жители деревни знают об этом и поэтому стараются обходить его стороной, заодно и не разрешая своим детям играть с Наруто. Мечтает стать хокагэ.
Сэйю: Такэути Дзюнко
Саскэ Учиха — основной друг и соперник главного героя. Одарённый, самостоятельный, эгоистичный, переживший в детстве большую психологическую травму и до сих пор не оправившийся от нее и стремящийся убить своего брата
(т.к. тот уничтожил весь клан Утиха, кроме Саскэ).

Сакура Харуно  — девушка, нравящаяся главному герою, но влюблённая не в него. Специально чтобы нравиться Сасукэ отрастила длинные волосы (т.к. ходили слухи, что ему нравятся девушки с длинными волосами), но позднее в процессе битвы, чтобы не провалить миссию и остаться в живых, ей пришлось их отрезать. По мнению многих людей похожа на пятого хокагэ и, позднее, свою наставницу Цунадэ.
Сэйю: Накамура Тиэ
Какаши Хатакэ  — дзёнин Конохи. Известен как копирующий ниндзя. Обожает книги серии «Вперёд, вперёд в рай», автором которых является Дзирайя. Всегда носит повязку, закрывающую пол-лица и левый глаз-Сяринган. Учитель Наруто, Сасукэ и Сакуры. Невозмутимый, жесткий и в то же время заботливый. Всё время опаздывает. Один из самых сильных ниндзя селения, человек, овладевший более чем тысячью различных дзюцу. Хатакэ Какаси никогда раньше не имел учеников. Все они отсеивались еще на стадии выпускного экзамена Академии Ниндзя. Так что первыми, сумевшими растопить сердце сурового сенсея, стали наши герои, команда №7. Теперь он состоит при них в должности руководителя и учителя одновременно... Про Какаси-сэнсея не так много известно даже самому Хокагэ, его прошлое, как и его лицо, скрыто ото всех.

Сверстники Наруто
Шино Абурамэ  — загадочный и держащийся на расстоянии партнёр Кибы и Хинаты, наследник клана ниндзя, пользующегося в бою насекомыми.
Тёдзи Акимити — толстый или, по его собственным словам, ширококостный приятель Сикамару и Ино, использующий свой вес в битвах. Почти всё время думает только о еде. Наследник клана, специализирующегося на лекарствах и стимуляторах.
Гаара — наследник поста Кадзэкагэ (аналогично хокагэ) в деревне (Селение Песка), неожиданно становящийся другом Наруто. Впервые познакомился с Наруто и его товарищами на экзамене на тюнина.
Киба Инудзука  — ниндзя, дерущийся в паре со своим псом (Акамару (яп. 赤丸 Акамару)).
Канкуро — ниндзя из Селения Песка, дерущийся с помощью марионеток. Брат Гаары и Тэмари.
Сикамару Нара — один из самых умных, но ленивых друзей главного героя, большой стратег и хорошо играет в сёги.
Рок Ли — классический герой восточного боевика, безответно сохнущий по Сакуре. Верит в то, что упорно тренируясь, сможет победить даже самых одарённых противников.
Тэмари  — старшая сестра Гаары и Канкуро (тоже из Селения Песка), использует в битвах огромный веер.
Тэнтэн  — девушка-ниндзя из отряда Рока Ли и Нэдзи, специализируется на различных видах метательного оружия.
Нэдзи Хюга  — гениальный ниндзя, считавшийся до экзаменационной битвы с Наруто самым сильным среди сверстников, использует «бякуган».
Хината Хюга  — двоюродная сестра Нэдзи, очень скромная и менее одарённая, но официально наследующая пост главы клана, тайно влюблённая в Наруто.
Ино Яманака — вечная соперница Сакуры и её подруга.

Учителя команд
Асума Сарутоби  — тренер команды № 10, состоящей из Нара Сикамару, Ино Яманака и Тёдзи Акимити. Постоянно курит.
Курэнай Юхи  — тренер команды № 8, состоящей из Хината Хюга, Киба Инудзука и Сино Абурамэ.
Майто Гай — тренер команды, состоящей из Нэдзи Хюга, Тэнтэн и Рок Ли. Вечно спорит и соперничает с Какаси.

Три легендарных ниндзя
Дзирайя , он же Гама Сэннин — пример того, что может получиться из Наруто через 40 лет. Сильный и умный, но немного легкомысленный ниндзя, хобби которого — тайком наблюдать за женскими банями и пляжами. Пишет книги порнографического содержания.
Цунадэ  — лучшая из всех ниндзя-медиков. С некоторого момента становится хокагэ.
Оротимару — основной антагонист, убивший хокагэ и похитивший Сасукэ.

Акацки
Акацки — организация, одной из целей которого является поимка всех «хвостатых» чудовищ, один из которых скрывается внутри главного героя. Первоначально Оротимару также был членом Акацуки.

Итати Утиха — родной брат Сасукэ, который, при помощи Мадары практически уничтожил клан Утиха и у которого есть Мангэкё-Сяринган.
Кисамэ Хосигаки (яп. 干柿鬼鮫 Хосигаки Кисамэ)— синоби из селения Скрытого Тумана, обладает самым большим запасом чакры в Акацуки. Оружие - Самехада, меч вытягивающий чакру.
Акасуна но Сасори  — один из сильнейших повелителей марионеток, великий кукольник, превращающий людей в марионеток. Прячется в марионетке Хируко. Специалист по ядам, поэтому любой его удар смертелен. Большая коллекция человеческих марионеток. Не любит ждать сам и заставлять ждать других людей.
Дэйдара - специалист в работе со взрывчаткой, которую делает из специального сорта глины, перерабатывая её в своем теле, управляет бомбами с помощью собственной чакры. Любимая фраза: "Исскуство - это взрыв".
Дзэцу
Хидан — бессмертный. Использует проклятие, связывающее свое тело с телом противника. Нанося себе смертельную рану убивает противника.
Какудзу  — Финансист Акацки. Имеет пять сердец, захваченных у других Синоби, что позволяет ему использовать одновременно пять стихий (обычные Синоби могут использовать только одну, обладатели улучшенного генома - две), что дает ему коллосальное преимущество в бою.
Тоби  — Основатель клана Утиха и один из основателей Конохи, и собственно настоящий Лидер Акацуки. Раньше был известен под именем Утиха Мадара. Настоящее имя и личность, знают только Итати и Пэйн (офицальный лидер Акацуки).
Пэйн - Официальный лидер Акацуки. Владеет сильнейшим додзюцу Риннеганом.
Конан - единственная девушка в Акацуки.

Первый: Сёдай хокагэ, основатель селения Коноха (вокруг которого разворачиваются основные события).
Третий хокагэПервый: Сёдай хокагэ , основатель селения Коноха (вокруг которого разворачиваются основные события).
Второй: Нидайме хокагэ , брат Первого.
Третий: Сандайме хокагэ , он же Сарутоби . Ученик Первого и Второго, учитель трёх легендарных ниндзя, один из которых - Оротимару.
Четвёртый: Йондайме хокагэ , он же Коноха но Киирой Сэнко ,настоящее имя Намиказе Минато, отец Удзумаки Наруто, ученик Дзирайи, погибший в битве с демоническим Девятихвостым Лисом и заточивший дух того в теле главного героя.
Пятый: Годайме хокагэ , она же Цунадэ